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达氏鲟内参基因β-actin、GAPDH和EF1-α的克隆及生物信息学分析

文献类型: 会议论文

第一作者: CHEN Hu

作者: CHEN Hu 1 ; 陈虎 1 ; 吴源冰 1 ; WU Yuanbing 1 ; TANG Ni 1 ; 唐妮 2 ; QI Jing-wen 1 ; 齐锦雯 1 ;

作者机构: 1.四川农业大学动物科技学院,成都611130

2.四川省农业科学院水产研究所,宜宾6440001

关键词: 达氏鲟;β肌动蛋白;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;延伸因子1α;基因克隆;生物信息学

会议名称: 2018南方十六省(市、区)第三十四次水产学术年会

主办单位: 安徽省水产学会

页码: 00000184-00000192

摘要: 内参基因在实时荧光定量PCR(The fluorescence-based quantitative real-time PCR,qPCR)中十分重要,不同的试验条件需要不同的内参基因.本试验克隆鉴定了达氏鲟潜在qPCR 内参基因 β-actin、GAPDH 和EF1-α 的全长 CDS,分别为 1125bp、999bp 和1383bp,编码375个、333个和461个氨基酸.β-actin、GAPDH和EF1-α推导的蛋白质三级结构与小鼠类似.在脊椎动物中氨基酸的一致性以及系统进化树表明,这三个基因高度保守.本试验将为达氏鲟qPCR内参选择提供更多的基因,为qPCR技术在达氏鲟各项研究中的运用奠定基础.

分类号: Q959.463.03

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