文献类型： 中文期刊

作者： 伏荣桃 ¹ ; 王剑 ¹ ; 陈诚 ¹ ; 龚学书 ¹ ; 卢代华 ¹ ; 罗曦 ¹ ; 郑爱萍 ¹ ;

作者机构： 1.四川省农业科学院植物保护研究所农业部西南作物有害生物综合治理重点实验室;四川农业大学水稻研究所

关键词： 稻曲病菌;CTAB;SDS;基因组小文库

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 102-106

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 水稻稻曲病是由稻曲病菌引起的真菌病害,现已成为水稻重要的病害之一。旨在寻找一种最佳的稻曲病菌基因组DNA提取方法,并构建基因组小文库。采用CTAB、SDS和真菌DNA试剂盒3种提取方法提取稻曲病菌基因组DNA,并用Illumina系统测序分析,构建基因组小文库。结果显示,CTAB提取法能得到高质量的基因组DNA,小文库测序组装共得29 350288碱基(bp)和17 908 Scaffold,总碱基的GC含量为49.79%。CTAB提取法是稻曲病菌基因组DNA最佳的提取方法,基因组小文库成功的构建为稻曲病菌的基因组gap的填补和致病相关基因的鉴定提供了数据资源。