文献类型： 中文期刊
作者： 陶璇 1 ; 梁艳 1 ; 杨雪梅 1 ; 汪勇 1 ; 杨跃奎 1 ; 孔繁晶 1 ; 王言 1 ; 龚建军 1 ; 朱康平 1 ; 卫纪 1 ; 杨少鹏 1 ; 吕学斌 1 ; 顾以韧 1 ; 何志平 1 ;
作者机构： 1.四川省畜牧科学研究院/动物遗传育种四川省重点实验室;泸州市农业农村局;泸州市现代农业发展促进中心;四川德康农牧食品集团股份有限公司;稻城县农牧农村和科技局;白河县农业农村局
关键词： ACAT1;群体遗传分化指数;基因组重测序;分子育种;猪;SNP
期刊名称： 中国猪业
ISSN： 1673-4645
年卷期： 2024 年 19 卷 001 期
页码： 39-46
摘要： 通过对我国地方猪种与国外猪种比较,筛选与生长发育性状相关的差异候选基因,探索猪种之间生长发育差异的分子机制.分别选择5头内江猪和大约克夏猪进行全基因组重测序,以10 kb滑动窗口和1 kb步长计算群体间遗传分化指数(Fst)平均值,并依据Fst筛选差异SNPs.最终在内江猪与大约克夏猪的比较中分别鉴定出48 924个非同义SNP,它们高度影响2 490个基因.同时,在乙酰辅酶A乙酰转移酶1(ACAT1)、胰岛素样生长因子受体2(IGF2R)和胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白3(IGF2BP3)基因中检测到3个非同义SNP,这可能影响乙酰辅酶A向乙酰乙酰辅酶A的转化和胰岛素信号通路的正常功能.本研究结果将为探索决定猪表型特征的遗传差异提供基础信息.
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