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苏云金芽孢杆菌杀虫晶体蛋白基因cry1A的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 吴钢 1 ; 王闵霞 2 ; 朱旭东 3 ; 蒲志刚 2 ; 张志勇 2 ; 彭正松 4 ; 蔡平钟 2 ;

作者机构： 1.四川省蚕业管理总站

2.四川省农业科学院生物技术核技术研究所

3.中国水稻研究所

4.西华师范大学

关键词： cry1A基因;苏云金芽孢杆菌;克隆;生物信息学

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2010 年 23 卷 02 期

页码： 393-398

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以分离的3株苏云金芽孢杆菌质粒为模板,通过设计一对特异引物,PCR扩增得到3条全长3.6 kb的基因序列,其各自都包含一个完整的开放阅读框,编码序列全长分别是3468、3450、2697 bp(Genebank登录号分别为GQ385073,GQ385074,GQ385075);它们与cry1A类基因同源性都高达95%以上;分别编码1159、1150和902个氨基酸。并在此基础上采用生物信息学方法对这3个基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域以及功能域等方面进行了预测和分析。为转基因抗虫植物和微生物杀虫工程菌的构建提供了基因来源。

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