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内江猪的遗传结构分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨雪梅 1 ; 陶璇 1 ; 顾以韧 2 ; 梁艳 1 ; 雷云峰 1 ; 杨跃奎 1 ; 曾凯 1 ; 王言 1 ; 陈晓晖 1 ; 龚建军 1 ; 吕学斌 1 ;

作者机构: 1.四川省畜牧科学研究院

2.西南民族大学

关键词: 内江猪;SNP芯片;遗传结构

期刊名称: 畜牧与兽医

ISSN: 0529-5130

年卷期: 2024 年 56 卷 009 期

页码: 23-27

收录情况: 北大核心

摘要: 旨在研究内江猪群体的亲缘关系和遗传结构。采用“中芯一号”芯片检测30头内江猪的单核苷酸多态性(SNP);采用GCTA软件构建G矩阵,PLINK软件构建状态同源(IBS)距离矩阵,分析内江猪群体的亲缘关系;采用Mega X软件构建群体进化树,分析内江猪群体的遗传结构。结果:共检测到57 466个SNP位点,29 468个SNP位点通过质量控制;内江猪试验群体具有中等程度的亲缘关系;群体进化树将内江猪公猪被分为6个血缘,血缘数量与传统系谱记录的基本相同;基于连续性纯合片段(ROH)的平均近交系数为0.243。综上,内江猪血缘较少,有一定程度的近交,可引入新血缘,提高群体遗传多样性和种群质量。

  • 相关文献

[1]川乡黑猪基因组选择信号分析. 梁艳,顾以韧,刘鹏亮,郝晓东,弥世荣,陶璇,杨雪梅,杨跃奎,王言,陈晓晖,龚建军,吕学斌,何志平. 2024

[2]基于SNP芯片的丫杈猪保种群体遗传结构研究. 陶璇,杨雪梅,梁艳,刘一辉,汪勇,孔繁晶,雷云峰,杨跃奎,王言,安瑞,杨坤,吕学斌,何志平,顾以韧. 2023

[3]川乡黑猪与地方猪杂交后代的毛色、肉品质及生产性能观测. 杨坤,陈晓晖,安瑞,杨雪梅,梁艳,陶璇. 2025

[4]基于SCoT分子标记的甘薯及其野生种遗传多样性分析. 冯俊彦,康乐,郎涛,张聪,李明,赵珊,蒲志刚. 2021

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