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拟南芥冷诱导CBF/DREB类结合因子的克隆及其生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 蔡平钟 1 ; 张志雄 1 ; 马林 2 ; 向跃武 1 ;

作者机构: 1.四川省农业科学院生物技术核技术研究所

2.西南科技大学生命科学与工程学院

关键词: CBF/DREB;结合因子;克隆;生物信息学

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2009 年 2009 卷 06 期

页码: 86-90

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: CBF/DREB结合因子广泛存在于植物中,主要参与诸如干旱、高盐以及冷胁迫等相关基因的表达调控。以拟南芥DNA为模板,PCR扩增出3个冷诱导的CBF/DREB结合因子,即CBF1、CBF2及CBF3,利用生物信息学手段对三者的cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、功能域、进化树、二级结构及DNA保守域的三级结构等进行了较为全面的分析。结果显示,CBF1、CBF2和CBF3的氨基酸序列同源性很高,达到91.4%,且都属于亲水性蛋白,三者在理化性质以及蛋白质二级结构乃至三级结构上也极为相似。另外,CBF1和CBF2都不具跨膜结构,CBF3含有1个跨膜螺旋。

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