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三种葡萄病毒的RT-PCR检测和系统进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘建军 1 ; 陈克玲 1 ; 李洪雯 1 ; 何建 1 ;

作者机构： 1.四川省农业科学院园艺研究所

关键词： 葡萄卷叶伴随2型病毒;葡萄B病毒;葡萄A病毒;病毒外壳蛋白基因;病毒沉默抑制子基因

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2013 年 30 卷 02 期

页码： 197-201

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】为了研究不同葡萄病毒病快速检测方法和四川分离株系统进化,【方法】比较3种葡萄总RNA提取方法,还优化了葡萄病毒病的RT-PCR检测方法。分别克隆了3种病毒四川分离株的部分基因组区域,并开展了系统进化分析。【结果】结果表明,改进硅胶颗粒吸附法快速从葡萄枝条的韧皮组织中提取了总RNA,并以葡萄18SRNA为内参基因,RT-PCR分别成功扩增出3种病毒的目的片段。把16个地理起源的GLRaV-2分离株的外壳蛋白基因(Coat protein,CP)分成5个系统进化组。而7个地理起源的GVB分离株CP同源性为79.1%～98.7%。此外,5个GVA四川分离株分别位于系统进化树的4个聚类群。【结论】GLRaV-2、GVB和GVA不同地理起源的分离株在核酸水平上具有变异性,其中GVA四川分离株之间具有显著的遗传差异,可能包括4种株系。

  • 相关文献

[1]葡萄卷叶伴随3型病毒和葡萄A病毒的多重检测及其系统进化分析. 刘建军,陈克玲,李洪雯,席德慧,林宏辉. 2011

[2]葡萄A病毒四川分离物的外壳蛋白基因克隆与原核表达. 刘晓,席德慧,袁澍,蒋彧,杨辉,杜俊波,张中伟,陈克玲,林宏辉. 2008

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