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白菜型油菜BrBBX家族的鉴定与BrBBX46和BrBBX53基因的胁迫响应分析

文献类型： 中文期刊

作者： 皮博艺 1 ; 聂治 1 ; 杜文平 1 ; 余桂容 1 ; 甘雨 1 ; 宋军 1 ;

作者机构： 1.四川省农业科学院生物技术核技术研究所

关键词： 白菜型油菜;BBX家族;BrBBX46;BrBBX53;生物信息学;胁迫响应

期刊名称： 寒旱农业科学

ISSN： 1001-1463

年卷期： 2024 年 3 卷 001 期

页码： 26-36

摘要： BBX是一类重要的锌指蛋白转录因子家族,包含 1~2 个高度保守位于蛋白质序列N端的BBX结构域,在调控植物的生长发育和响应环境胁迫中发挥着重要作用.利用生物信息学分析手段,在白菜型油菜中鉴定出 59 个BrBBX家族成员,对它们的染色体定位、基因结构、蛋白保守结构域,以及BrBBX46 和BrBBX53 基因的启动子进行了分析,并用qRT-PCR技术鉴定了BrBBX46 和BrBBX53 基因在模拟干旱和盐胁迫下的表达水平.结果显示,59 个BrBBXs不均匀地分布于白菜型油菜基因组的 10 条染色体.通过对系统进化、基因结构、蛋白保守结构域的分析,59 个BrBBXs被分为 5 个亚族,每个亚族的基因结构、蛋白结构域和保守基序均相对保守,同一亚族的成员具有相似的基因结构和保守结构域.对启动子的分析结果显示,BrBBX46 和BrBBX53 基因的启动子中均含有大量的胁迫相关响应元件,尤其是干旱胁迫响应元件,二者均有 14 个;在 40%PEG和 120 mmol/L NaCl处理下,二者的表达水平均显著上升,说明BrBBX46 和BrBBX53 基因能够响应干旱和盐胁迫的诱导,可能在干旱和盐胁迫下发挥着重要功能.以上结果为进一步了解和利用BrBBX家族成员改良白菜型油菜耐旱耐盐新品种提供了良好的基因资源.

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