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猕猴桃LysM型类受体激酶基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 何蕾 1 ; 王文霞 1 ; 胡容平 2 ; 尹恒 1 ;

作者机构： 1.中国科学院大连化学物理研究所

2.四川省农业科学院植物保护研究所

关键词： 猕猴桃;LysM-类受体激酶;基因家族;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 010 期

页码： 3191-3198

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物Lys M型类受体激酶基因家族（lysin motif receptor-like kinase, LYKs）在植物自身免疫防御系统及与病原微生物协同进化中的重要作用已被证实，目前已成为研究植物基因功能的热点。本研究以生物信息学方法在猕猴桃全基因组范围内鉴定并命名Ac LysM基因家族成员，分析其家族成员染色体定位、蛋白基序、结构域和亚细胞定位，以及AcLysM基因家族成员的蛋白理化性质。共获得40个AcLysM基因家族成员，其蛋白分子量范围为10～126 kD、等电点在4.43～9.42之间，平均亲水系数介于-0.603～0.484。AcLysM基因家族成员分为三个亚类，亲缘关系较近的家族成员往往具有相同的motif和domain，甚至多个基序和结构域的排序都是相似的，推测该亚族成员在猕猴桃进化过程中执行相似的功能，在响应猕猴桃病菌侵染的过程中发挥重要的激发、传导和调控作用。本研究分析了猕猴桃LysM型类受体激酶基因家族，为后续深入研究LysM基因家族成员在猕猴桃抵御病虫害中的作用提供理论依据。

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