科研产出
红肉枇杷和白肉枇杷果实成熟不同阶段的比较转录组研究
《分子植物育种 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：本研究对红肉枇杷和白肉枇杷在果实转色到成熟间的4个时期(授粉后第171天,第175天,第180天,第185天)样本进行转录组测序。除去低质量数据后共得到约9.5 Gb的Clean reads,组装出61 587条Unigenes。在阈值为|log2 Ratio|≥1和Probability>0.8时,共检测到28 216个Unigenes(13 676个上调和14 540个下调)差异表达。Gene Ontology(GO)和KEGG分析表明有40个GO类别和121代谢通路显著富集,涉及次级代谢物合成、植物激素信号传导、氧化磷酸化、糖酵解、淀粉与蔗糖代谢、氨基糖与核糖代谢等。此外从中鉴定出21个与类胡萝卜素代谢相关的基因,大部分基因在授粉后171 d时在红肉枇杷果肉中的表达量要显著高于白肉枇杷。研究结果为枇杷果肉颜色形成机制的阐明和枇杷遗传改良育种提供了理论依据。
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盐碱胁迫下GF677和毛桃根部显微观察和比较转录组分析
《分子植物育种 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：土壤盐碱化已成为危害植物生长的重要因素之一。本研究中,我们对盐碱胁迫下两种桃树(GF677和毛桃)的根部分别进行细胞学观察和比较转录组分析。扫描电子显微镜结果表明GF677根部的根毛密度要显著多于毛桃根部。比较转录组分析显示在|log2 Ratio|≥1和Probability>0.8的阈值下共检测到1 379个基因差异表达,其中279个上调,1 100个下调。对差异表达基因进行Gene ontology(GO)聚类共得到27个小类显著富集。Pathway富集分析显示脯氨酸代谢、类黄酮代谢和氧化磷酸化代谢等通路在GF677中被显著激活,暗示了GF677可能通过提高渗透压和维持氧化还原平衡使植物体免受盐碱胁迫的危害。研究结果为耐盐碱基因挖掘以及桃树耐盐碱分子改良育种提供了理论依据。
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