南瓜小西葫芦黄花叶病毒四川分离物的鉴定与遗传进化分析

陈诚; 王剑; 伏荣桃; 陈晓娟; 李星月; 陈雪娟; 卢代华; 《生态学杂志 》 2025 北大核心 CSCD

摘要：为了了解产生花叶症状的南瓜是否含有植物病毒，本研究采用小RNA深度测序等技术对四川地区南瓜样品进行分析，获得小西葫芦黄花叶病毒(zucchini yellow mosaic virus, ZYMV)的全基因组，命名为SCSN分离物。SCSN分离物基因组全长9572 nt,编码一个351.1 kDa的多聚蛋白。序列一致性分析表明，SCSN与中国浙江的WM分离物相似性最高，其多聚蛋白氨基酸一致性为97.4%。重组分析表明，SCSN分离物是由WM分离物和西班牙的Ver分离物重组而成的。将SCSN全基因组序列与GenBank中基因组长度超过9300 nt的159条序列共同构建系统进化树，表明来自于28个国家和地区的ZYMV分离物聚为7个类群，其中SCSN分离物聚为第1类群。进一步分析表明，ZYMV的系统进化与地理分布存在相关性，且存在优势ZYMV类群。这是四川ZYMV分离物全基因组的首次报道，研究为防范ZYMV通过远距离传播扩散危害提供理论依据。

关键词： 小西葫芦黄花叶病毒 分离物 全基因组 重组 系统进化 南瓜