基于DElncRNA-miRNA-mRNA网络化解析藏鸡低氧适应性

张增荣; 蒋小松; 邱莫寒; 余春林; 杜华锐; 李晴云; 彭涵; 熊霞; 宋小燕; 胡陈明; 夏波; 杨礼; 陈家磊; 杨朝武; 《中国家禽 》 2023 北大核心

摘要：为了探讨藏鸡低氧适应机制，试验对藏鸡和大恒鸡胚胎心脏组织进行全转录组测序分析，构建了包括5个DElncRNAs、3个miRNAs、19个靶基因参与的ceRNA网络，通过实时荧光定量PCR验证5个候选lncRNAs。结果显示：ENSGALG00000050044、ENSGALG00000008047和ENSGALG00000053982在藏鸡中的表达水平显著低于大恒鸡（P＜0.05），获得42条网络化通路与氧化代谢或能量代谢有关。研究表明，藏鸡对低氧的适应不是通过单一途径实现的，可能是通过协调多个mi RNAs的表达变化，触发不同的靶基因和代谢途径来实现，结果为研究生物适应低氧条件提供了新的思路。

关键词： 藏鸡 全转录组 网络化图谱构建 低氧适应机制