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资源类型: 中文期刊
关键词:网络药理学(模糊匹配)
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基于网络药理学及分子对接技术探究猴头菇治疗慢性胃炎的潜在作用机制

《菌物学报 》 2023 北大核心 CSCD

摘要:猴头菇是一种珍贵的食药两用大型真菌,常用于慢性胃炎、胃溃疡的治疗。为了探究猴头菇治疗慢性胃炎、胃溃疡的作用机制,本研究采用网络药理学方法筛选出猴头菇的活性成分、潜在作用靶点及相关信号通路,并通过分子对接技术对关键的化合物与潜在作用靶点的结合能力进行验证。研究结果表明,猴头菇中121个次级代谢产物和163个靶点共同参与慢性胃炎、胃溃疡治疗,蛋白质互作网络分析显示VEGFA、JUN、STAT3、TNF、IL6、ALB、AKT1和EGFR等为关键靶点,KEGG通路富集筛选得到28条信号通路。分子对接结果显示,猴头菇治疗慢性胃炎、胃溃疡的潜在关键化合物fomentarolA(24)、erinarolH(21)、(22E,24R)-6-O-acetylergosta-7,22-diene-3β,5α,6β-triol(14)和染料木素(genistein,110)分别与AKT1、JAK2、PTGS2、PPARG、EGFR、ALB和TNF等靶点具有十分良好的结合性能。本研究首次采用网络药理学方法对猴头菇治疗慢性胃炎、胃溃疡可能的作用机制进行了研究。结果表明猴头菇的活性成分可以通过多通路作用于多个靶点来治疗慢性胃炎、胃溃疡,为其临床使用提供了一定的科学依据。

关键词: 猴头菇 慢性胃炎 胃溃疡 网络药理学 分子对接

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基于网络药理学与分子对接技术研究淫羊藿治疗少弱精症的作用机制

《中国实验方剂学杂志 》 2022 北大核心 CSCD

摘要:目的:利用网络药理学、分子对接技术探究淫羊藿治疗少弱精症的有效成分及作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出淫羊藿主要活性成分及对应靶点基因;通过GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获得少弱精症靶点基因;利用UniProt对所有基因进行校正;利用Cytoscape3.9.0软件构建药物-活性成分-关键靶点调控网络,根据度值筛选关键活性成分;将活性成分与疾病共同靶点上传至STRING 11.5数据库构建淫羊藿靶蛋白-少弱精症靶蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,根据度值筛选关键蛋白靶点;利用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科(KEGG)通路富集分析;利用Protein Data Bank(PDB)数据库及TCMSP数据库获得靶蛋白和活性成分的分子结构,通过AutoDock Vina 1.1.2软件对活性成分及核心蛋白靶点进行分子对接;最后通过淫羊藿活性成分淫羊藿苷干预少弱精症模型大鼠,验证淫羊藿苷对蛋白靶点表达的影响.结果:从淫羊藿中筛选出23个活性成分,淫羊藿与少弱精症的共同关键靶点50个,核心靶点6个,包括肿瘤蛋白p53(TP53)、表皮生长因子受体(EGFR)、前列腺素G/H合酶2(PTGS2)、胱天蛋白酶(Caspase)-3、受体酪氨酸蛋白激酶erbB-2(ERBB2)、Caspase-9.GO功能富集与KEGG信号通路富集分析淫羊藿活性成分主要参与P53信号通路、癌症途径、细胞增殖和凋亡等.分子对接结果提示淫羊藿苷、槲皮素、8-异戊烯醇三个活性成分与靶蛋白结合能力较强.淫羊藿苷干预实验结果表明,与空白组比较,少弱精模型大鼠睾丸中靶蛋白表达显著下调;与少弱精症模型大鼠组比,淫羊藿苷可显著上调靶蛋白在淫羊藿苷组睾丸中靶蛋白的表达(P<0.05).结论:淫羊藿主要通过淫羊藿苷、8-(3-甲基丁-2-烯基)-2-苯基色酮、8-异戊烯醇,调节P53信号通路、癌症途径、细胞增殖和凋亡等路径发挥治疗少弱精症的作用.

关键词: 淫羊藿 少弱精症 网络药理学 分子对接 实验验证

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