科研产出
南瓜小西葫芦黄花叶病毒四川分离物的鉴定与遗传进化分析
《生态学杂志 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了了解产生花叶症状的南瓜是否含有植物病毒，本研究采用小RNA深度测序等技术对四川地区南瓜样品进行分析，获得小西葫芦黄花叶病毒(zucchini yellow mosaic virus, ZYMV)的全基因组，命名为SCSN分离物。SCSN分离物基因组全长9572 nt,编码一个351.1 kDa的多聚蛋白。序列一致性分析表明，SCSN与中国浙江的WM分离物相似性最高，其多聚蛋白氨基酸一致性为97.4%。重组分析表明，SCSN分离物是由WM分离物和西班牙的Ver分离物重组而成的。将SCSN全基因组序列与GenBank中基因组长度超过9300 nt的159条序列共同构建系统进化树，表明来自于28个国家和地区的ZYMV分离物聚为7个类群，其中SCSN分离物聚为第1类群。进一步分析表明，ZYMV的系统进化与地理分布存在相关性，且存在优势ZYMV类群。这是四川ZYMV分离物全基因组的首次报道，研究为防范ZYMV通过远距离传播扩散危害提供理论依据。
关键词： 小西葫芦黄花叶病毒 分离物 全基因组 重组 系统进化 南瓜
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三株海南岛野生灵芝的鉴定、多糖组成及其抗氧化活性研究
《天然产物研究与开发 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为探究海南岛部分野生灵芝的功效活性以及对野生灵芝的合理利用,分别对采集于海南岛的三株野生灵芝进行了形态和分子鉴定,并对子实体多糖的单糖组分和抗氧化活性进行了分析.结果表明,HN-1为紫芝(Ganoderma sinense)、HN-2为南方灵芝(Ganoderma australe)、HN-3为无柄紫灵芝(Ganoderma mastoporum);三株灵芝多糖的单糖组成和摩尔比存在一定的差异,HN-1多糖主要由甘露糖、木糖、鼠李糖组成,其摩尔比为1∶0.29∶0.14,HN-2多糖主要由甘露糖、葡萄糖组成,其摩尔比为1∶1.7,HN-3多糖主要由甘露糖、木糖、葡萄糖组成,其摩尔比1∶1.98∶1.8;三株灵芝的多糖都具有较强的抗氧化能力,其抗氧化能力都随着多糖质量浓度的增加而提高,HN-1的抗氧化活性最强,其次是HN-3,HN-2的抗氧化活性最弱.该研究结果为更好的保护和利用海南岛野生灵芝资源提供了基础资料,具有一定的参考价值.
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MALDI-TOF MS与16SrDNA方法对肠杆菌科微生物鉴定比较分析
《质谱学报 》 2018 EI 北大核心 CSCD
摘要：为了研究基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法鉴定肠杆菌科微生物及其对微生物系统分类学相关分析的准确性,采用MALDI-TOF MS对金桔表面分离的10种肠杆菌科微生物进行蛋白质图谱收集,通过比对图谱特征峰实现微生物的鉴定与系统进化学分析;同时对10种微生物进行16SrDNA提取与测序,得到分子生物化学水平鉴定,并采用邻近连接法对16SrDNA序列做系统进化树分析。结果表明:MALDI-TOF MS与16SrDNA测序对10种肠杆菌科微生物鉴定结果中,克雷伯菌属2株菌鉴定种级有偏差,其他8种一致;MALDI-TOF MS与16SrDNA测得的数据都可计算微生物相关性,从而得到微生物系统发育树,两株系统发育树中同属级微生物归类的亲缘位置与方向一致,但不同属肠杆菌科微生物的亲缘距离与位置差异较大。MALDI-TOF MS法鉴定农产品表面微生物具有快速、准确的特点,但准确建立系统发育相关性还需要扩大数据库和优化算法。
关键词： 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS) 16SrDNA 肠杆菌科微生物 系统进化
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