科研产出
川芎基因组survey测序及其特征分析
《中草药 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：目的 利用流式细胞术和高通量测序技术，对川芎Ligusticum chuanxiong基因组大小和特征进行分析，为川芎全基因组精细测序和分子机制研究奠定基础。方法 以已知基因组大小的绿豆和陆地棉作为内标植物，用流式细胞术估算川芎基因组大小。利用高通量测序技术对川芎基因组进行survey分析，测算出川芎基因组大小、重复序列、杂合率和GC含量等，利用生物信息学对基因组进行预测、注释和基因家族鉴定。结果 估算出川芎基因组大小约为3058.37Mb，重复序列为79.79%，杂合率约2.16%,GC含量为36.32%，川芎基因组呈现高重复、高杂合、基因组庞大等特征。共预测到34864个基因，有30 737个基因在功能数据库中被注释，有53个基因注释到阿魏酸合成过程中。初步鉴定到2058个特异基因家族，2001个单拷贝基因。结论 初步获得了川芎基因组大小、基因组特征、功能基因及基因家族等信息，为进一步川芎全基因组精细测序提供了参考，为阐明川芎阿魏酸等药效成分生物合成提供了基因资源。
关键词： 川芎 流式细胞术 高通量测序技术 survery分析 基因组大小 基因组特征
全文链接
请求原文
鸡外周血T淋巴细胞分群及免疫相关基因表达分析
《中国家禽 》 2023 北大核心
摘要：为探索鸡抗病育种中简便实用的免疫功能测定指标，试验采用成像流式细胞术对四川山地乌骨鸡和大恒699肉鸡配套系的4周龄和10周龄外周血进行T淋巴细胞亚群分型，并检测外周血中白介素6（IL-6）、Toll样受体3（TLR3）和干扰素（IFN-γ）基因的表达水平。结果显示：10周龄时，CD4+T淋巴细胞亚群在两鸡种间差异显著（P＜0.05）,4周龄和10周龄的两鸡种CD8+T淋巴细胞亚群均有极显著差异（P＜0.01）;CD4+/CD8+比值在0.7～1.6之间呈正态分布，且随周龄增加而降低；大恒699肉鸡配套系的CD4+/CD8+比值比四川山地乌骨鸡高；IL-6和IFN-γ表达量随周龄增加而增加，但TLR3相反。细胞因子的增多和CD4+/CD8+比值的降低表明鸡只随周龄增长，机体免疫平衡发生改变。结果表明，基于成像流式细胞术进行鸡外周血T淋巴细胞分型简易可行，CD4+/CD8+比值可作为鸡免疫力检测的一个指标；天然免疫相关基因IL-6、TLR3和IFN-γ基因的表达量可以作为免疫力检测的参考。
关键词： 鸡外周血 CD4+/CD8+比值 流式细胞术 淋巴细胞亚群 天然免疫相关基因
全文链接
请求原文
首页上一页1下一页尾页
