斯氏艾美耳球虫感染兔肠道菌群的变化分析

陈晓娣; 康润敏; 杨锐; 张先惠; 肖璐; 陈飞; 柴勇; 于吉锋; 谢晶; 曹冶; 叶建强; 吴学婧; 毛从剑; 潘梦; 李兴玉; 魏勇; 叶勇刚; 《中国养兔 》 2024

摘要：研究旨在分析斯氏艾美耳球虫感染兔肠道菌群的结构组成变化.选取12只雌性新西兰白兔,随机分为感染组(G3)和对照组(C3),G3兔灌胃感染1.0×105个斯氏艾美耳球虫孢子化卵囊,C3兔灌胃等量生理盐水.在感染后第23天收集对照组和感染组兔小肠内容物,提取DNA,并对其进行16S rRNA测序及生物信息学分析.结果发现,对照组和感染组兔肠道菌群的Alpha多样性没有显著差异,而β多样性发生变化,表明两组的菌群结构不同.Metastats分析发现,与C3组相比,G3组兔肠道中拟杆菌属(Bacteroides),副杆菌属(Parabacteroides),罕见小球菌属(Subdoligranulum)以及具有抗炎作用的Lachno-clostridium属丰度显著升高(P<0.05);而类芽孢杆菌(Paenibacillus)(P<0.05)的丰度显著下降.同样,LEfSe分析中也发现拟杆菌的丰度明显升高(P<0.05).综上所述,斯氏艾美耳球虫感染兔肠道菌群的组成与对照组相比有明显的不同.

关键词： 斯氏艾美耳球虫 新西兰白兔 肠道菌群