科研产出
保温发酵鱼露中细菌群落的16S rDNA分子生态分析
《食品工业科技 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：本文通过对细菌16S rDNA V4区进行高通量测序,并结合实时荧光定量PCR法(FQ-PCR)研究35℃发酵条件下鱼露的细菌群落多样性.研究发现发酵初期细菌数量快速下降,到后期数量基本保持稳定.鱼露中细菌群落组成复杂,在测序得到的所有细菌OTUs中共注释出37个门、238个属,但有50%左右的OTUs未能注释到属.发酵8个月后,继续增加发酵时间,鱼露中的细菌组成变化不明显.在门的水平上,在鱼露发酵的各个阶段中细菌主要分布在变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes);在属分类的水平上,优势菌主要有乳杆菌属(Lactobacillus)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、假单胞菌属(Pseudomonas)、链球菌属(Streptococcus)、不动菌属(Acinetobacter)等.发酵前2个月,优势菌是嗜冷杆菌属(Psychrobacter,23.39%)、链球菌属(Streptococcus,5.34%)、乳杆菌属(Lactobacillus,3.05%),发酵12个月时,主要优势菌中变形菌门中以链球菌属(Streptococcus,3.62%)、乳杆菌属(Lactobacillus,3.23%)、葡萄球菌属(Staphylococcus,1.20%)为主,而厚壁菌门以不动菌属(Acinetobacter,9.14%)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter,8.77%)、假单胞菌属(Pseudomonas,6.78%)为主,其中耐盐和嗜盐的乳酸菌主要有乳杆菌属(Lactobacillus)、链球菌属(Streptococcus)等.
关键词： 16S rDNA 鱼露 保温发酵 细菌群落 乳酸菌
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实时荧光定量PCR法定量微生物的条件及在鱼露和虾油微生物检测中的应用研究
《食品与发酵工业 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：文中研究了以实时荧光定量PCR法(FQ-PCR)定量细菌和真菌数量的条件,通过比较多对引物的扩增效果,确定分别采用16S rDNA细菌通用引物63F-335R和18S rDNA真菌通用引物0817F-1196R扩增细菌和真菌,并确定退火温度均为60℃。采用多种细菌和真菌对上述条件进行验证,结果显示,无论单一菌种或混合菌种,在上述条件下扩增效率E均在90%~120%范围内,所得标准曲线决定系数R~2>0.98,符合定量要求。用此方法定量鱼露和虾油的微生物,结果显示鱼露发酵过程中细菌数量在3.16×10~4~3.16×10~5个/m L范围内变动,数量远高于真菌数,而且该法测得的细菌和真菌数比平板计数法高1~2个数量级。
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