科研产出
康定冬虫夏草子囊孢子弹射期土壤细菌群落研究
《中国食用菌 》 2020
摘要：为探究四川甘孜藏族自治州康定市冬虫夏草（Ophiocordyceps sinensis）在子囊孢子弹射期土壤理化因子和细菌群落组成,找出可能影响冬虫夏草子囊孢子弹射的关键菌群,为更好开展冬虫夏草人工抚育奠定基础。以康定冬虫夏草人工抚育基地土壤为研究对象,对冬虫夏草虫体周际土壤和对照土壤进行高通量测序和土壤理化因子分析。结果显示:冬虫夏草虫体周际有机质（OM）、总氮（TN）、碱解氮（AN）、pH、镉（Cd）、铅（Pb）、汞（Hg）和砷（As）均显著低于对照地（P<0.05）,有相对更高含量的速效钾。样品细菌群落划分为33门、126纲、230目、375科、592属。门水平上,Proteobacteria、Acidobacteria和Actinobacteria为相对丰度最高的前三个门,三者占样品相对丰度比78.29%～81.47%,且Proteobacteria与Hg、AN和OM呈正相关;Acidobacteria与AP呈正相关,与OM、TN、Pb和As呈负相关;Actinobacteria与AK和OM呈正相关。属水平上,Rhodoplanes、DA101 （未命名）、Candidatus Solibacter、Ralstonia、Ochrobactrum、Rhodococcus等无论是否在冬虫夏草产地都有分布,以Rhodoplanes在J1、J2和J3中平均相对丰度分别为6.33%、6.28%和4.41%,显著高于J4的1.96%。研究结果对冬虫夏草子囊孢子弹射期其虫体周际土壤重金属、常规理化性质及土壤细菌组成有了进一步的认识,对更好开发康定市冬虫夏草资源具有重要意义。
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保温发酵鱼露中细菌群落的16S rDNA分子生态分析
《食品工业科技 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：本文通过对细菌16S rDNA V4区进行高通量测序,并结合实时荧光定量PCR法(FQ-PCR)研究35℃发酵条件下鱼露的细菌群落多样性.研究发现发酵初期细菌数量快速下降,到后期数量基本保持稳定.鱼露中细菌群落组成复杂,在测序得到的所有细菌OTUs中共注释出37个门、238个属,但有50%左右的OTUs未能注释到属.发酵8个月后,继续增加发酵时间,鱼露中的细菌组成变化不明显.在门的水平上,在鱼露发酵的各个阶段中细菌主要分布在变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes);在属分类的水平上,优势菌主要有乳杆菌属(Lactobacillus)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、假单胞菌属(Pseudomonas)、链球菌属(Streptococcus)、不动菌属(Acinetobacter)等.发酵前2个月,优势菌是嗜冷杆菌属(Psychrobacter,23.39%)、链球菌属(Streptococcus,5.34%)、乳杆菌属(Lactobacillus,3.05%),发酵12个月时,主要优势菌中变形菌门中以链球菌属(Streptococcus,3.62%)、乳杆菌属(Lactobacillus,3.23%)、葡萄球菌属(Staphylococcus,1.20%)为主,而厚壁菌门以不动菌属(Acinetobacter,9.14%)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter,8.77%)、假单胞菌属(Pseudomonas,6.78%)为主,其中耐盐和嗜盐的乳酸菌主要有乳杆菌属(Lactobacillus)、链球菌属(Streptococcus)等.
关键词： 16S rDNA 鱼露 保温发酵 细菌群落 乳酸菌
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不同品种桑树根际土壤细菌群落及土壤理化性质的研究
《蚕业科学 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：桑树与土壤的物质交换发生在根际土层,研究不同品种桑树根际土壤的细菌群落,对了解不同品种桑树的根系生理活动差异,确定有利于桑树生长发育的土壤细菌群落生态系统有重要意义。对采集的不同品种桑树根际土壤细菌的16S r DNA部分序列进行PCR,根据扩增产物的变性梯度凝胶电泳(DGGE)图谱计算Shannon-Weaver多样性指数(H)、丰富度(S)和均匀度(E),并结合土壤理化性质,对20个桑品种的桑树根际土壤细菌群落的多样性进行分析。在一定范围内,各桑品种的桑树根际土壤细菌群落多样性指数与含水率和速效钾含量呈负相关,而与p H值及碱解氮、速效磷、有机质和全氮含量呈正相关,说明不同品种桑树根系的生理活动影响到根际土壤的理化性质;不同品种桑树根际土壤中存在共有的细菌,根际土壤细菌16S r DNA扩增产物的DGGE图谱呈现13个优势条带,其中4个条带属于γ-变形菌纲,有4个条带属于拟杆菌门,占条带总数的57.14%,为桑树根际土壤中的优势菌群;20个桑品种的桑树根际土壤样品细菌群落的Shannon-Weaver指数,以实钴11-6最高,桐乡青最低,说明不同品种桑树的根际土壤细菌群落多样性存在差异。综上结果建议生产上选择适合桑品种的栽培土壤并改善土壤质量和施用高效微生物肥料,促进桑树根际土壤优势菌群的形成,从而促进桑树生长。
关键词： 桑品种 根际土壤 细菌群落 16S r DNA 变性梯度凝胶电泳 土壤理化性质
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