科研产出
环境变化对水稻osfh1突变体成蛋白家族表达的影响
《广西植物 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：水稻成蛋白基因成员OsFH1在水稻根毛的生长发育中起着关键作用，这一过程受到环境因素的调控，当前的研究对环境因素如何与OsFH1互作调控水稻根毛的机制尚未阐明。为探索水稻成蛋白成员是否在环境因素介导的osfh1突变体根毛表型恢复中发挥作用，该研究使用1/2 MS液体培养液与1/2 MS固体培养基处理osfh1突变体，通过qRT-PCR技术分析成蛋白家族成员表达量，并对成蛋白家族进行生物信息学分析。结果表明：（1）与野生型相比，在液培中osfh1突变体主根根毛缺失，地上部分较短，侧根数量增加，在固体培养中osfh1突变体根毛缺失表型得到恢复。（2）与野生型相比，当osfh1突变体从液培到固培环境时，OsFH16表达量下降，OsFH17表达量上升，并且差异显著。（3）OsFH1、OsFH16、OsFH17都是第一类成蛋白亚家族成员，都具有生长素、赤霉素以及厌氧等与环境胁迫相关顺式作用元件，并且预测到OsFH1、OsFH16和OsFH17定位于质膜行使功能。（4）OsFHs在不同组织的表达模式分析表明，OsFH1在根部表达水平较高，而OsFH16、OsFH17在根部表达量相对较低。综上认为，由于OsFH16、OsFH17、OsFH1之间亲缘关系较高，调控模式相近且三者都可能在细胞质膜上行使功能，因此OsFH16、OsFH17可能参与环境因素与osfh1共同改变根毛表型这一过程。该研究结果为解析环境与osfh1基因共同调控水稻根毛发育机制奠定了一定理论基础，为探索植物成蛋白基因功能提出了新方向。
关键词： 成蛋白 OsFH1 根毛 qRT-PCR 水稻 生物信息分析
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实时荧光定量PCR方法检测转基因玉米MIR604
《浙江农业学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：转基因玉米MIR604是瑞士先正达公司2005年研发的抗虫玉米,中国于2008年批准MIR604进口作为食品和饲料的加工原料。为了精确定量检测MIR604及其加工产品,在MIR604的左侧边界序列和玉米基因组之间设计引物和探针,成功建立了MIR604品系特异实时荧光定量PCR检测方法。采用该方法设计的引物和探针,对6种非转基因作物、MIR604及其他非目标转基因作物进行检测,除MIR604外,其余样品均未检测到MIR604分子片段的扩增信号;对已知含量为1%的MIR604标准品进行定量检测,测量值为1.07%,接近真实值1%;灵敏度实验结果显示,该方法能检测到仅5个拷贝的MIR604分子片段。该试验所建立的MIR604品系特异实时荧光定量PCR检测方法具有较高的特异性、准确度及灵敏度,可用于转基因玉米MIR604的定量检测。
关键词： 转基因玉米MIR604 实时荧光定量PCR 特异性 准确度 灵敏度
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实时荧光定量PCR检测转基因玉米MON88017
《江苏农业学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为完善中国转基因生物及产品定量分析标准化技术体系,保障中国生物安全和降低生态风险,本研究建立了转基因玉米MON88017及产品的实时荧光定量PCR分析方法,并用特异性、准确度、灵敏度以及测量不确定度等指标评价了该方法。结果显示该方法分析转基因玉米MON88017特异性很强;29次重复测量含量为1.50%的转基因玉米MON88017样品,平均测量值(1.541%)接近真实值(1.50%),相对偏差为2.70%,测量值的变异系数为0.110 4,回收率为100.00%,测量不确定度为0.096;在97.5%的置信水平下能检测到最低含量为5个拷贝的MON88017分子片段。因此,本研究建立的转基因玉米MON88017实时荧光定量PCR方法具有较高的特异性、准确度和灵敏度,能为中国转基因生物安全监管提供良好的技术支撑。
关键词： 转基因玉米MON88017 实时荧光定量PCR 特异性 灵敏度 精确度 测量不确定度
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转基因玉米MIR604结构特异片段实时荧光定量检测方法的建立
《江苏农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：根据转基因玉米MIR604外源载体序列,设计引物和探针,并优化反应体系和热循环条件,建立了MIR604结构特异片断实时荧光定量PCR检测方法。采用该方法对6种非转基因作物、MIR604及其他非目标转基因作物进行检测,除MIR604外,其余样品均未检测到MIR604分子片段的扩增信号;对含量为1%的MIR604标准品进行定量检测,测试样品平均含量为1.05%;灵敏度测试结果显示该方法能检测到仅5个拷贝的MIR604分子片段。因此,本研究建立的方法具有较高的特异性、准确度及灵敏度,能为中国转基因生物安全监管提供技术支持。
关键词： 转基因玉米 结构特异性 实时荧光定量PCR 灵敏度 准确度
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甘蓝型油菜开花调控转录因子CONSTANS的表达分析
《中国农业科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：[目的]研究开花调控转录因子CONSTANS(CO)同源基因在甘蓝型油菜中的表达特征.[方法]以早熟甘蓝型油菜品系D626-6和晚熟甘蓝型油菜品系D125-5为材料,依据甘蓝型油菜CONSTANS同源基因Bn1CON19设计特异性引物扩增CO基因全长编码区,并根据获得的cDNA序列设计实时荧光定量特异性引物,采用SYBR GreenI染料法进行实时荧光定量PCR研究CO基因表达差异.[结果]在整个生育期内,早熟和晚熟甘蓝型油菜品系的CO基因以叶片中的表达量最高,花蕾和茎中表达量次之,且早晚表达量高于中午时分;在不同生育时期内,抽薹期表达量最大,且早熟甘蓝型油菜品系CO基因在叶片和花蕾中的表达明显高于晚熟甘蓝型油菜品系.[结论]CO同源基因在甘蓝型油菜成花过程中以及生育期的长短上发挥着一定的作用.
关键词： 甘蓝型油菜 转录调控因子 CO基因(CONSTANS) 实时荧光定量PCR
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