科研产出
川明参转录组分析及SSR分子标记开发
《中药材 》 2019 北大核心
摘要：目的:获得川明参转录组信息,探索川明参多糖和黄酮类化合物生物合成途径相关的基因,开发高效的SSR分子标记。方法:利用Illumina HiSeq 2500高通量测序对川明参全株进行转录组测序,经CAP3软件拼接组装后获得Unigenes,然后进行生物信息学分析。结果:获得了46 576 691条Clean Reads。从头组装产生了64 984条Unigenes。通过Blastx比对分析显示,比对到Uniprot数据库的Unigenes有35 604条(54.80%),Nr数据库有35 591(54.80%)条,GO数据库有18 291条(28.20%),COG数据库有19 950条(30.70%)。8 141条Unigenes(12.50%)映射到242条代谢通路,其中,58条Unigenes参与黄酮类化合物的生物合成,128条Unigenes参与川明参多糖的生物合成,共编码了28种不同的酶。此外,检测到18 271个SSR位点,设计SSR引物842对,选择30对引物用于36份川明参样品的遗传多样性分析,其中13对引物能在36份样品中成功扩增出条带。结论:川明参转录组数据可为探索川明参次生代谢产物的生物合成机制提供重要的参考,也可为川明参的遗传多样性研究和分子标记辅助育种提供依据。
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川明参栽培后期生长动态与品质相关性探讨
《天然产物研究与开发 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：对川明参栽培后期生长动态进行观察,测定其根中淀粉、可溶性糖、水溶性浸出物、欧前胡素的含量,并进行生长动态与品质变化的相关性分析。结果表明:川明参栽培后期,药材淀粉含量急剧下降,可溶性糖、水溶性浸出物含量升高,欧前胡素含量太低且变化不明显。淀粉含量与折干率极显著正相关,对药材产量形成的贡献最大。3月中旬是青白江川明参适宜采收期,此时单株产量、单株浸出物量最大,干燥根淀粉含量达60%以上、折干率45%以上,叶片长势最为茂盛,80%植株花序梗高度达55~70 cm。
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