苏云金芽孢杆菌杀虫晶体蛋白基因cry1A的克隆及生物信息学分析

吴钢; 王闵霞; 朱旭东; 蒲志刚; 张志勇; 彭正松; 蔡平钟; 《西南农业学报 》 2010 北大核心 CSCD

摘要：以分离的3株苏云金芽孢杆菌质粒为模板,通过设计一对特异引物,PCR扩增得到3条全长3.6 kb的基因序列,其各自都包含一个完整的开放阅读框,编码序列全长分别是3468、3450、2697 bp(Genebank登录号分别为GQ385073,GQ385074,GQ385075);它们与cry1A类基因同源性都高达95%以上;分别编码1159、1150和902个氨基酸。并在此基础上采用生物信息学方法对这3个基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域以及功能域等方面进行了预测和分析。为转基因抗虫植物和微生物杀虫工程菌的构建提供了基因来源。

关键词： cry1A基因 苏云金芽孢杆菌 克隆 生物信息学