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rDNA-ITS序列分析法鉴定桑椹菌核病病原菌

文献类型： 中文期刊

作者： 危玲 1 ; 黄盖群 1 ; 朱洪庆 2 ; 曾贞 1 ; 刘刚 1 ; 殷浩 1 ; 王香君 1 ; 夏川林 1 ;

作者机构： 1.四川省农业科学院蚕业研究所

2.南充市农业科学研究所

关键词： rDNA-ITS;测序;桑椹菌核病病原菌;鉴定

期刊名称： 蚕业科学

ISSN： 0257-4799

年卷期： 2018 年 44 卷 006 期

页码： 962-967

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采集四川南充、绵阳、乐山等地果桑园中的真菌12株,利用ITS引物扩增并进行测序,构建系统进化树,分析12个真菌样品与已知物种的亲缘关系.结果表明,12个真菌样品扩增出的目的条带长度为500 bp,j1、J2、J3、J4、J5、J7、J8、J12菌株与桑实杯盘菌(Ciboria shiraiana)的序列相似度最高,J6、J9菌株与小核盘菌(Sclerotinia minor)的序列相似度最高,J10菌株与肉阜状杯盘菌(Ciboria carunculoides)的序列相似度最高,J11菌株与桑椹核地杖菌(Scleromitula shiraiana)的序列相似度最高,且序列比对分析结果同传统形态学鉴定结果完全一致.2种方法相结合最终得出结论:J1、J2、J3、J4、J5、J7、J8、J12菌株为桑实杯盘菌;J6、J9菌株为小核盘菌;J10菌株为肉阜状杯盘菌;J11菌株为桑椹核地杖菌.与传统形态学鉴定法相比,rDNA-ITS序列分析法具有准确度高,不受真菌样品生长情况、地理环境影响等优点,可避免因形态特征掌握不足而导致的不确定性,2种方法相结合在真菌鉴定中会有更广泛、更深入的应用.

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