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资源类型: 中文期刊
关键词:变性梯度凝胶电泳(模糊匹配)
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泸州老窖不同窖龄窖泥中乳酸菌多样性PCR-DGGE分析

应用与环境生物学报 2013 北大核心 CSCD

摘要:乳酸菌是窖泥中的重要功能菌群,参与了浓香型白酒风味形成,因而探明窖泥中乳酸菌的种群特征,对于提高白酒品质具有重要意义.采用PCR-DGGE技术对泸州老窖不同窖龄窖泥乳酸菌种群进行了分析.结果显示,根据DGGE图谱条带情况,不同窖泥样品中乳酸菌多样性差异明显;多样性指数分析结果表明,样品的Patrick丰富度指数R介于14-19,Shannon-Wiener指数H值介于2.634 5-2.888 9之间,Simpson指数C值介于0.055 7-0.071 9.根据图谱选取16条DGGE条带进行序列分析,它们分属于Lactobacillus(乳杆菌属)、Pediococcus(片球菌属)、Weissella(魏斯氏菌属)、Enterococcus(肠球菌属)、Exiguobacterium(微小杆菌属)、Bacillus(杆菌属)、Rummeliibacillus属以及Cohnella属,其中Lactobacillus(乳杆菌属)为优势菌属,L.acetotolerans(耐酸乳杆菌)为窖泥中乳酸菌的优势种群.图5表2参24

关键词: 窖泥 PCR-DGGE 泸型酒 乳酸菌 多样性

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长期定位施肥对石灰性紫色水稻土AMF多样性的影响

菌物学报 2012 北大核心 CSCD

摘要:为了解长期定位施肥对石灰性紫色水稻土丛枝菌根真菌(AMF)物种多样性的影响,从稻麦轮作下连续26年定位施农家肥(M)、氮肥+农家肥(NM)、氮磷肥+农家肥(NPM)、氮磷钾肥+农家肥(NPKM)、不施肥(CK)、氮肥(N)、氮磷肥(NP)、氮磷钾肥(NPK)等不同施肥处理小区采集根区土样,分离鉴定AMF、测定多样性特征。共鉴定出17种AMF,其中球囊霉属Glomus12种,占已分离总数的70.5%,为优势属;无梗囊霉属Acaulospora3种,占17.6%;原囊霉属Archaeospora和内养囊霉属Entrophospora各1种,各占5.9%。无论是石灰性紫色土种植水稻还是小麦,AMF侵染率最高的施肥处理均为无肥处理(CK),施肥特别是磷肥,降低AMF侵染率、孢子密度、相对多度和种丰度。变性梯度凝胶电泳(denaturinggradient gel electrophoresis,DGGE)分析结果表明,不施肥对照(CK)的AMF多样性最丰富,多样性指数最高,水稻和小麦种植下的多样性指数分别为2.68和3.02;与无机肥处理相比,农家肥配施无机肥提高了AMF多样性指数。农家肥配施无机肥更有利于AMF发育。

关键词: NPK肥料 农家肥 土壤质量 表型分析 变性梯度凝胶电泳

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烟草成熟期根际硝化细菌种群的结构及其多样性

中国农业科学 2011 北大核心 CSCD

摘要:【目的】研究烟草成熟期的根际及非根际土壤硝化细菌群落结构和多样性。【方法】运用PCR-DGGE技术对攀枝花市盐边县主要烟区采集的5个烟草根际土样和5个非根际土样进行分析。【结果】所有样品的DGGE图谱表明:各个土壤的硝化细菌群落结构和多样性有较大差异。根际土壤的多样性指数(H)、丰度(S)及均匀度(EH)并非都高于非根际土壤,这可能与烟草成熟期根系分泌物对硝化细菌的抑制有关。不同的土壤类型间的硝化细菌结构有较大的差异。回收的DGGE条带序列结果显示,大部分与冰川、溶岩等极端环境中非培养硝化螺菌属(Nitrospira sp.)相近,而小部分与目前尚未可知的非培养硝化细菌相近。【结论】成熟期的烟草根际土壤中硝化细菌多样性程度总体优于非根际土壤。

关键词: 烟草 成熟期 硝化细菌 群落结构 PCR-DGGE

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变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术在土壤微生物多样性研究中的应用

土壤 2008 北大核心 CSCD

摘要:应用变性梯度凝胶电泳(DGGE)谱图分析技术对土壤微生物多样性进行描述,可以克服传统微生物分离纯化培养方法和显微技术的局限性。本文介绍了变性梯度凝胶电泳指纹图谱分析方法及其在土壤微生物多样性中的应用,包括对土壤特殊微生物生理类群,自然环境条件下微生物多样性变化,污染土壤微生物的多样性,不同种植制度下的土壤微生物多样性,转基因植物、微生物介入的土壤微生物多样性等方面的研究。

关键词: 变性梯度凝胶电泳 16S rDNA PCR 土壤微生物多样性

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