科研产出
环境变化对水稻osfh1突变体成蛋白家族表达的影响
《广西植物 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：水稻成蛋白基因成员OsFH1在水稻根毛的生长发育中起着关键作用，这一过程受到环境因素的调控，当前的研究对环境因素如何与OsFH1互作调控水稻根毛的机制尚未阐明。为探索水稻成蛋白成员是否在环境因素介导的osfh1突变体根毛表型恢复中发挥作用，该研究使用1/2 MS液体培养液与1/2 MS固体培养基处理osfh1突变体，通过qRT-PCR技术分析成蛋白家族成员表达量，并对成蛋白家族进行生物信息学分析。结果表明：（1）与野生型相比，在液培中osfh1突变体主根根毛缺失，地上部分较短，侧根数量增加，在固体培养中osfh1突变体根毛缺失表型得到恢复。（2）与野生型相比，当osfh1突变体从液培到固培环境时，OsFH16表达量下降，OsFH17表达量上升，并且差异显著。（3）OsFH1、OsFH16、OsFH17都是第一类成蛋白亚家族成员，都具有生长素、赤霉素以及厌氧等与环境胁迫相关顺式作用元件，并且预测到OsFH1、OsFH16和OsFH17定位于质膜行使功能。（4）OsFHs在不同组织的表达模式分析表明，OsFH1在根部表达水平较高，而OsFH16、OsFH17在根部表达量相对较低。综上认为，由于OsFH16、OsFH17、OsFH1之间亲缘关系较高，调控模式相近且三者都可能在细胞质膜上行使功能，因此OsFH16、OsFH17可能参与环境因素与osfh1共同改变根毛表型这一过程。该研究结果为解析环境与osfh1基因共同调控水稻根毛发育机制奠定了一定理论基础，为探索植物成蛋白基因功能提出了新方向。
关键词： 成蛋白 OsFH1 根毛 qRT-PCR 水稻 生物信息分析
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实时定量PCR评估金针菇的内参基因稳定性
《菌物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：金针菇在中国和日本是最受人喜爱的食用菌之一,在重要栽培食用菌中产销量排名第四。近年来,已在活性物质、分子标记及基因鉴定方面开展了大量工作,但未见有金针菇内参基因稳定性研究的报道,导致金针菇基因表达研究无内源参考基因稳定性数据作为参考。本研究采用ge Norm、Norm Finder、Best Keeper和Ref Finder4种软件评估18S核糖体RNA（18S）、28S核糖体RNA（28S）、60S核糖体蛋白L18（Rpl18）、肌动蛋白1（Act1）、3-磷酸甘油醛脱氢酶（Gapdh）、翻译延伸因子EF1-alpha（Ef1A）、DNA指导的RNA聚合酶亚基2（Rpb2）、细胞色素C氧化酶亚基1（Cox1）及细胞色素b（Cyt B）等9个内参基因的稳定性。综合分析结果显示,单个基因中Act1基因最稳定,Cyt B表达稳定性最差,但单个候选内参基因的稳定性不能够满足定量PCR实验要求;根据ge Norm软件分析结果,Cyt B和Rpb2是金针菇定量PCR的稳定内参基因组合。本研究首次评估了金针菇的内参基因稳定性,将为后续的基因表达研究提供参考。
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家蚕健康性分子检测研究
《西南农业学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：家蚕体内的热激蛋白数量与家蚕材料的健康性呈现有规律的变化,利用生物信息学分析方法筛选出具有代表性的家蚕热激蛋白基因(Bmhsp24.3)并对其进行实时定量(Real Time PCR)表达分析。结果表明,目的基因Bmhsp24.3在不同家蚕材料中都有所表达,但在不同材料间的表达差异很明显;饲育条件不同,该基因相对表达水平有着不同程度的变化,饲育温度的升高,该基因的表达量都有不同程度的提高;健康性好的材料,目的基因的表达量增加的较多,健康性差的材料,目的基因表达量增加的较少。目的基因Bmhsp24.3在不同材料间的表达差异,刚好与品种的健康性保持一致。本研究实验结果说明材料的健康性与目的基因Bmhsp24.3表达量存在相关性,目的基因Bmhsp24.3表达量越高,材料的健康性越好;反之,目的基因Bmhsp24.3表达量越低,材料的健康性越差。
关键词： 家蚕Bmhsp24.3 健康性 实时定量PCR
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家蚕健康性分子检测的研究(英文)
《Agricultural Science & Technology 》 2012
摘要：[目的]探索家蚕体内的热激蛋白表达量与家蚕材料的健康性变化的规律。[方法]利用生物信息学分析方法筛选出具有代表性的家蚕热激蛋白基因(Bmhsp24.3)并对其进行实时定量(RealTimePCR)表达分析。[结果]目的基因Bmhsp24.3在不同家蚕材料中都有所表达,但在不同材料间的表达差异很明显;饲育条件不同,该基因相对表达水平有着不同程度的变化,饲育温度的升高,该基因的表达量都有不同程度的提高,健康性好的材料,目的基因的表达量增加的较多,健康性差的材料,目的基因表达量增加的较少。目的基因Bmhsp24.3在不同材料间的表达差异,刚好与品种的健康性保持一致。[结论]材料的健康性与目的基因Bmhsp24.3表达量存在相关性,目的基因Bmhsp24.3表达量越高,材料的健康性越好;反之,目的基因Bmhsp24.3表达量越低,材料的健康性越差。
关键词： 家蚕Bmhsp 24.3 健康性 实时定量PCR
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