科研产出
黄肉猕猴桃中果皮和内果皮不同时期比较转录组分析
《分子植物育种 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：类胡萝卜素是果实中的重要色素之一。本研究中,我们对黄肉猕猴桃(‘金实1号’)中果皮与内果皮4个不同发育时期(开花后0 d, 44 d, 81 d, 189 d,分别标注为T1时期, T2时期, T3时期, T4时期)类胡萝卜素含量测定结果表明,类胡萝卜素含量在T1时期最高,而后随着果实的发育逐步降低,在果实成熟期(T4时期)又有一定程度升高。转录组分析显示在|log2 Ratio|≥1和FDR<0.05阈值下,中果皮和内果皮在T2、T3、T4时期检测到的差异基因数目分别为5 665个、6 288个、9 293个和5 010个、5 524个、9 190个。Gene Ontology (GO)分析表明,这些差异表达基因被富集到50个GO类别,其中属于"生物学过程"的有22个类别,属于"细胞组分"的有16个类别,属于"分子功能"的有12个类别。此外我们还鉴定到14个类胡萝卜素生物合成相关基因差异表达,其中3个基因随果实发育上调表达,11个基因随果实发育下调表达,这一结果与类胡萝卜素含量变化模式相吻合。本研究有助于认识果实中类胡萝卜素调控机制,并且对今后彩色猕猴桃选育种工作有一定的指导意义。
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红肉猕猴桃果实发育期不同果肉部位比较转录组分析
《分子植物育种 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：红肉猕猴桃中果皮和内果皮在果实发育不同时期色泽变化模式有显著差异,但目前对于其内在的分子调控机制尚不清楚。本研究中,利用高通量测序技术,对红肉猕猴桃(‘红实2号’)中果皮与内果皮4个不同发育时期(开花后0 d, 28 d, 75 d, 157 d,分别标注为T1时期, T2时期, T3时期, T4时期)的样本进行转录组测序。经去除低质量数据后,得到Clean reads数目为2 192～4 331万,检测到的基因数目为24 607～29 170个。在(log2 Ratio)≥1和FDR<0.05阈值下,中果皮和内果皮在T2、T3、T4时期检测到的差异基因数目分别为1 880个、4 799个、7 346个和4 31个、1 493个、7 700个。KEGG分析显示这些差异表达基因被富集到68个代谢途径,包括DNA复制、RNA转运、蛋白质输出、植物激素信号转导、类黄酮生物合成、花青素合成、淀粉与蔗糖的代谢等。此外我们还鉴定到13个花青素合成相关基因差异表达,大部分基因的表达量随果实的发育呈现下降趋势,这一结果与花青素含量变化模式相吻合。本研究不仅深化了对猕猴桃果实成色差异机理的认识,还对今后的彩色猕猴桃选育种工作有一定的帮助。
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