棉花矮化突变体AS98差异基因表达cDNA-AFLP分析

钟文娟; 张超; 戢沛城; 龚一耘; 牟方生; 蒲德强; 袁灿; 杜雄明; 《西南农业学报 》 2017 北大核心 CSCD

摘要：【目的】为了探究矮化突变体AS98发生变异的分子生物学机制,【方法】本研究利用正常陆地棉品种LHF10W99(简称LHF)与AS98杂交后代分离出的正常表现型植株和极端矮化表现型植株,在现蕾期提取2种株型的茎尖、茎和根的RNA,利用cDNA-AFLP技术分析2种植株茎尖的表达差异。【结果】筛选到差异表达的片段32条,对这32条片段进行克隆测序,利用生物信息学进行分析发现其中一条(HD61)与拟南芥的阿拉伯半乳聚糖蛋白的同源性较高。用棉花的阿拉伯半乳聚糖蛋白(Gh AGP)的序列设计引物,用RT-PCR方法检验阿拉伯半乳聚糖蛋白在2类植株的茎尖、茎和根等组织上的表达量,结果表明,Gh AGP基因在突变型和正常型材料的茎、根上的表达量基本相同,但是在茎尖上却表现出明显的差异,突变型茎尖上的表达量显著低于正常型茎尖的表达量,说明Gh AGP可能参与棉花茎尖细胞的伸长生长过程。【结论】AS98的半乳糖代谢的改变可能与赤霉素(GA)合成中基因发生突变有关,不能合成正常具有生物活性的GA,使得阿拉伯半乳聚糖蛋白等基因在AS98茎尖的表达减少甚至缺乏。

关键词： 棉花 矮化突变体 cDNA-AFLP