基于Solexa平台高通量测序数据的分析与处理流程研究

曹艳; 雷波; 唐江云; 胡亮; 《农业网络信息 》 2015

摘要：第二代测序技术的诞生为生物信息学研究带来了前所未有的机遇,同时也对测序数据的处理分析提出了很高的要求。目前针对第二代测序数据的分析软件很多,但是绝大多数软件仅能完成单一的功能,如何正确高效地选择整合这些软件已成为迫切需求。本文基于新一代Illumina/Solexa测序平台所产生的数据,构建了一套完整的数据处理和分析流程,实现对测序数据有效分析和处理。对数据处理过程中所用的软件和方法做了全面综述,并对生物信息数据处理研究中存在的难题做了进一步展望。

关键词： 高通量 Solexa FASTQ 生物信息学 农业信息化