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基于Solexa平台高通量测序数据的分析与处理流程研究

文献类型: 中文期刊

作者: 曹艳 1 ; 雷波 1 ; 唐江云 1 ; 胡亮 1 ;

作者机构: 1.四川省农科院农业信息与农村经济研究所

关键词: 高通量;Solexa;FASTQ;生物信息学;农业信息化

期刊名称: 农业网络信息

ISSN: 1672-6251

年卷期: 2015 年 12 期

页码: 32-38

摘要: 第二代测序技术的诞生为生物信息学研究带来了前所未有的机遇,同时也对测序数据的处理分析提出了很高的要求。目前针对第二代测序数据的分析软件很多,但是绝大多数软件仅能完成单一的功能,如何正确高效地选择整合这些软件已成为迫切需求。本文基于新一代Illumina/Solexa测序平台所产生的数据,构建了一套完整的数据处理和分析流程,实现对测序数据有效分析和处理。对数据处理过程中所用的软件和方法做了全面综述,并对生物信息数据处理研究中存在的难题做了进一步展望。

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