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MALDI-TOF MS与16SrDNA方法对肠杆菌科微生物鉴定比较分析

文献类型： 中文期刊

作者： 代晓航 1 ; 郭灵安 1 ; 刘炜 1 ; 赵欢 2 ;

作者机构： 1.;四川省农科院分析测试中心;华西师范大学生命科学院

2.;四川省农科院分析测试中心;华西师范大学生命科学院;

关键词： 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS);16SrDNA;肠杆菌科微生物;系统进化

期刊名称： 质谱学报

ISSN： 1004-2997

年卷期： 2018 年 02 期

页码： 209-215

收录情况： EI ; 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法鉴定肠杆菌科微生物及其对微生物系统分类学相关分析的准确性,采用MALDI-TOF MS对金桔表面分离的10种肠杆菌科微生物进行蛋白质图谱收集,通过比对图谱特征峰实现微生物的鉴定与系统进化学分析;同时对10种微生物进行16SrDNA提取与测序,得到分子生物化学水平鉴定,并采用邻近连接法对16SrDNA序列做系统进化树分析。结果表明:MALDI-TOF MS与16SrDNA测序对10种肠杆菌科微生物鉴定结果中,克雷伯菌属2株菌鉴定种级有偏差,其他8种一致;MALDI-TOF MS与16SrDNA测得的数据都可计算微生物相关性,从而得到微生物系统发育树,两株系统发育树中同属级微生物归类的亲缘位置与方向一致,但不同属肠杆菌科微生物的亲缘距离与位置差异较大。MALDI-TOF MS法鉴定农产品表面微生物具有快速、准确的特点,但准确建立系统发育相关性还需要扩大数据库和优化算法。

  • 相关文献

[1]MALDI-TOF-MS对金桔表面肠杆菌科微生物分布的研究. 郭灵安,代晓航. 2017

[2]1株产纤维素酶菌株的筛选及酶学性质的研究. 何兵,许鹏,雷波. 2013

[3]三株海南岛野生灵芝的鉴定、多糖组成及其抗氧化活性研究. 金鑫,熊川,李萍,李强,陈祖琴,张璐,黄文丽. 2020

[4]四种葡萄病毒外壳蛋白基因的系统进化研究. 刘建军,陈克玲,李洪雯,何建,关斌. 2009

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