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黑斑病菌诱导的紫薯抑制性差减杂交文库构建及ESTs分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张聪 1 ; 李明 1 ; 屈会娟 1 ; 张敏 2 ; 阎文昭 1 ; 蒲志刚 1 ;

作者机构： 1.四川省农业科学院生物技术核技术研究所

2.四川农业大学

关键词： 紫薯;黑斑病菌诱导;抑制差减杂交技术;表达序列标签

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2014 年 27 卷 01 期

页码： 53-58

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究以紫薯1号为材料,运用抑制性差减杂交(SSH)技术,构建了经黑斑病菌诱导12、24、36、48、60 h后的甘薯块根混合SSH cDNA文库。随机挑取103个cDNA克隆进行5'端测序,共获得87个非重复序列,其中包括29个重叠群,58个独立的ESTs,利用tblastx对87个序列在NCBI数据库中进行同源性比对。结果表明,在编号为14的EST中找到了"蔷薇"黑斑抗性muRdr1基因位点,基因全序列包括muRdr1A、muRdr1B、muRdr1C、muRdr1D、muRdr1E、muRdr1F、muRdr1G、muRdr1H、muRdr1I共9个基因。另外有2类基因的含量较高,一类是紫薯组织特异性相关基因,另一类是紫薯受干旱胁迫的抗逆相关基因。构建cDNA文库,应用EST技术并结合生物信息学技术,对紫薯抗病相关基因的表达分析,从基因水平上来研究紫薯抗病机制,为今后的紫薯抗病遗传育种及抗病机理奠定论基础。

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