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四川省丁香假单胞猕猴桃致病变种的遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨潇湘 1 ; 伍文宪 1 ; 黄小琴 1 ; 张蕾 1 ; 杜磊 1 ; 刘勇 1 ;

作者机构： 1.四川省农业科学院植物保护研究所;农业部西南作物有害生物综合治理重点实验室

关键词： 猕猴桃;丁香假单胞菌猕猴桃致病变种;rep-PCR;遗传多样性;遗传变异

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2020 年 09 期

页码： 132-137

摘要： 为明确四川省猕猴桃溃疡病菌丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,Psa)的遗传多样性及群组划分与地理来源的相关性。以四川省不同地理来源的40个Psa菌株为研究试材,用rep-PCR技术进行分子标记,NTSYS软件分析UPGMA聚类。3对rep-PCR检测引物(REP、ERIC和BOX)共获得42个位点,其中38个为多态位点,占90.5%。UPGMA聚类结果显示,以相似系数为0.70阀值时,40个Psa菌株被分为2个类群(Ⅰ、Ⅱ),其中85.0%的菌株属于第Ⅱ类群;在相似性系数为0.80时,第Ⅰ类又可分为2个亚类(Ⅰ-1、Ⅰ-2),第Ⅱ类则分为5个亚类(Ⅱ-1、Ⅱ-2、Ⅱ-3、Ⅱ-4、Ⅱ-5),菌株无明显的采集地聚类。以上结果表明,四川省各地区的猕猴桃溃疡病菌菌株具有较高的遗传多样性,但其遗传变异与菌株地理来源无明显相关性。

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