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资源类型: 中文期刊
关键词:复合侵染(模糊匹配)
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四川成都地区复合侵染南瓜4种病毒的分子鉴定分析

园艺学报 2021 北大核心 CSCD

摘要:南瓜近年来受到病毒病的危害日益严重。对从四川成都地区采集的典型病毒症状南瓜叶片,进行了small RNA(sRNA)深度测序分析,发现有4种病毒复合侵染,分别是瓜类蚜传黄化病毒(cucurbit aphid-borneyellowsvirus,CABYV)、番木瓜环斑病毒(papayaringspotvirus,PRSV)、西瓜花叶病毒(watermelon mosaic virus,WMV)和小西葫芦黄花叶病毒(zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)。依据s RNA测序结果设计病毒的特异引物,对提取的病毒样本RNA进行反转录PCR扩增,得到了预期大小的特异DNA片段,这些片段经Sanger测序分析,进一步证实了上述4种病毒的存在。将这些病毒序列与GenBank中相应序列进行比对分析发现,CABYV和ZYMV与近来在国内流行的病毒类型相似,而PRSV和WMV与国内其他地区的病毒相近,而且也与国外报道病毒相似;系统分析还发现,CABYV和PRSV在四川可能分别有两种病毒株系同时在流行。这些结果表明,在四川成都地区南瓜受到多种病毒复合侵染,病毒的传播和流行种类较为复杂,在生产上需要高度重视南瓜病毒病的防控。

关键词: 南瓜 病毒 复合侵染 CABYV PRSV WMV ZYMV

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侵染四川辣椒的番茄斑萎病毒和辣椒轻斑驳病毒的小RNA测序检测及鉴定

植物病理学报 2020 北大核心 CSCD

摘要:调查发现四川省汶川县当地辣椒的病毒病严重且症状多样,病样粗提液摩擦接种辣椒、矮牵牛和三生烟,出现辣椒系统性花叶焦枯和茎尖坏死,指示植物表现局部枯斑。对3个不同症状的病果进行sRNA深度测序鉴定,发现均含有番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)和辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus,PMMoV)。通过RT-PCR技术进行验证,结果显示所有病样的果皮和部分新鲜种子以及回接寄主的病叶均检测到TSWV和PMMoV,表明该地辣椒病毒病是由TSWV和PMMoV复合侵染引起。这是TSWV侵染四川辣椒的首次报道。分别基于TSWV N基因序列和PMMoV CP基因序列构建系统发育树,汶川分离物TSWV-WC(MK468469)与贵州分离物(KP684518)亲缘关系最近,PMMoV-WC(MK408614)与北京分离物(AY859497)亲缘关系最近。推测该地辣椒病毒病可能与品种引进有关。

关键词: 番茄斑萎病毒 辣椒轻斑驳病毒 复合侵染 深度测序

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